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发表于 2021-12-23 15:15:09
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DNA甲基化作为一种重要的表观修饰,在调控基因的时空特异性表达中扮演着关键的角色,参与英国乐透8了X染色体失活、基因组印记和重复序列抑制等诸多生命过程。哺乳动物细胞的DNA甲基化主要发生在CpG二核苷酸对的C(胞嘧啶)上,并在有丝分裂过程中得以相对稳定的维持,这对细胞保持谱系特性有着重要的意义。然而,由于方法和技术的限制,DNA甲基化维持的效率、动态过程及其相关调控因素研究得并不清楚。 这项工作首先建立了极速赛车研究DNA甲基化动态维持过程的新方法Hammer-seq。此方法结合了EdU(胸腺嘧啶类似物)标记新合成DNA链、点击化学反应在EdU位点添加biotin标签、Streptavidin免疫沉淀以及Hairpin亚硫酸盐全基因组甲基化测序等技术。Hammer-seq可以测定单个DNA分子内新旧CpG的甲基化状态,从而不仅可以测定甲基化的维持速率,还可以测定维持中可能伴随发生的从头甲基化事件。 研究发现,DNA甲基化可以在复制叉经过后数分钟内迅速恢复到较高的水平,说明存SG飞艇在一个复制偶联的快速维持阶段;而另一方面,即使复制叉经过后数小时,甲基化维持仍然在进行,说明同时存在一个复制非偶联的缓慢维持阶段。
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